99式自行榴弹炮的战斗全重为40吨，乘员4人，全长11.3米，全宽3.2米，全高4.3米。车体前部左侧为动力舱，右侧为驾驶室，车体中后部为战斗室。驾驶员席在右侧，这也和日本道路左侧通行的惯例有关。驾驶员上方有一个水平开启的舱门，有3具潜望镜。车体前部左侧顶部有水散热器的百叶窗。车体部分的外观和日本的89式步兵战车很相像。不过，日本军方称99式自行榴弹炮的车体是新设计的，但底盘上的某些部件可以和89式步兵战车的部件通用。车体和炮塔采用焊接结构，而一些舱门和盖板处多采用螺接结构。